O tomilho pode ser propagado por sementes ou por estacaria, sendo este último método o preferido, uma vez que o cultivo por sementes exige mais tempo para o crescimento das plantas e início da colheita.
As sementes podem ser plantadas diretamente num local definitivo da horta, mas uma vez que são muito pequenas, o ideal é semear em sementeiras e transplantar as mudas quando têm 4 pares de folhas definitivas. A germinação das sementes leva de uma a três semanas.
A propagação por estacaria, ou seja, por ramos cortados de plantas adultas saudáveis, é o método ideal porque produz plantas que são idênticas à planta mãe e estas exigem menos tempo para crescerem até à colheita. Este processo traduz-se no corte de ramos, mergulhando a sua metade inferior num recipiente com água até que surjam as raízes. Posteriormente plantam-se num local definitivo, ou em vasos mantidos bem húmidos por três ou quatro semanas.
O espaçamento entre as plantas deve ser geralmente de 15 cm a 20 cm.
O tomilho também pode ser facilmente cultivado em jardineiras e vasos.
É importante que retire plantas invasoras que estejam a consumir os seus nutrientes e recursos e tendo em conta que se trata de uma planta perene, pode ser cultivada por muitos anos mas torna-se lenhosa com a idade, a sua produtividade será maior se as plantas forem renovadas a cada dois ou três anos.